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Olá,
Gostaria de saber se tem algum problema os resultados dos resíduos de regressão, (preço observado, valor estimado e resíduos) estarem abaixo de zero?

Resíduos são necessariamente positivos e negativos. Já os preços e valores devem ser somente positivos.

Gostaria que desse uma olhada no arquivo em anexo, é um PrtSc da tela.

Provavelmente a variável dependente está na forma inversa (1/x). Por este motivo os preços observados e os valores estimados estão com valores na ordem de 0,01.... Os resíduos possuem valores positivos e negativos, portanto está ok. Os valores 0,00 são arredondamentos. Se o valor estimado for 0,011 e o preço 0,010 então a diferença entre preço e valor (resíduo) será de 0,001, cujo valor arredondado é de 0,00

Entendi, mas dessa forma o cálculo está errado? Se sim você teria alguma dica para melhorar o cálculo?

Não está errado. São os resultados obtidos. O que estaria errado seria valores negativos e não resíduos negativos.